Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIN1Q9NXP7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GIN1Q9NXP7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIN1Q9NXP7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms