Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCH5Q9NX47 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH5Q9NX47 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH5Q9NX47 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms