Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A7Q9NVC3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206 ms