Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDP1Q9NUW8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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