Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTG1Q9NSN8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNTG1Q9NSN8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms