Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FARSBQ9NSD9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms