Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms