Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCND1Q9NSA2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCND1Q9NSA2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms