Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD18Q9NS91 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms