Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DUOX1Q9NRD9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms