Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDGFCQ9NRA1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDGFCQ9NRA1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFCQ9NRA1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms