Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SEC31BQ9NQW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms