Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF12AQ9NP84 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF12AQ9NP84 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms