Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUFT1Q9NNX1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms