Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-5Q9HDB9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVK-5Q9HDB9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms