Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRMS1Q9HCU9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRMS1Q9HCU9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms