Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC4Q9HBW1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC4Q9HBW1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms