Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UPF2Q9HAU5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms