Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPCSQ9HAB8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms