Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NHEJ1Q9H9Q4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms