Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TDRD3Q9H7E2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD3Q9H7E2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD3Q9H7E2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD3Q9H7E2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms