Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C5orf42Q9H799 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C5orf42Q9H799 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf42Q9H799 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms