Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1DQ9H5J8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TAF1DQ9H5J8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms