Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms