Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NXF3Q9H4D5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms