Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms