Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARV1Q9H2C2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARV1Q9H2C2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms