Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX5Q9H2C1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX5Q9H2C1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms