Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms