Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL4Q9C0H6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms