Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BCO2Q9BYV7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCO2Q9BYV7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms