Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC46A2Q9BY10 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC46A2Q9BY10 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC46A2Q9BY10 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC46A2Q9BY10 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC46A2Q9BY10 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC46A2Q9BY10 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC46A2Q9BY10 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC46A2Q9BY10 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms