Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL25A1Q9BXS0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL25A1Q9BXS0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms