Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JAM3Q9BX67 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms