Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
C9orf16Q9BUW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf16Q9BUW7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms