Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB6Q9BUF5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB6Q9BUF5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms