Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C20orf78Q9BR46 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms