Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms