Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5SQ99766 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5SQ99766 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5SQ99766 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5SQ99766 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5SQ99766 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5SQ99766 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5SQ99766 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5SQ99766 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5SQ99766 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5SQ99766 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5SQ99766 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5SQ99766 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5SQ99766 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5SQ99766 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5SQ99766 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5SQ99766 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms