Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRTNQ99748 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRTNQ99748 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms