Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYSTQ99698 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYSTQ99698 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms