Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS8Q99627 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS8Q99627 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS8Q99627 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms