Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGMNQ99538 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms