Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARXQ96QS3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARXQ96QS3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms