Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNAQ96QF7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms