Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC85AQ96PX6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85AQ96PX6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms