Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP4

TSGA13, Testis-specific gene 13 protein, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA13Q96PP4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSGA13Q96PP4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSGA13Q96PP4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSGA13Q96PP4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSGA13Q96PP4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSGA13Q96PP4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSGA13Q96PP4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSGA13Q96PP4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSGA13Q96PP4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSGA13Q96PP4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA13Q96PP4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSGA13Q96PP4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms