Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms