Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD27Q96NW4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD27Q96NW4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms