Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346.4 ms